Aprendiz de Obi-Wan

"Mestre Yoda, eu dei minha palavra para Qui-Gon. Eu vou treinar Anakin, e sem a aprovação do Conselho se necessário”
”[...] Concordar com você, o Conselho vai. Seu aprendiz, Skywalker será."

―Obi-Wan Kenobi e Yoda.

    O relacionamento de Anakin e Obi-Wan teve um começo não muito bom. Obi-Wan não via potencial no garoto, e até o considerava perigoso. A única razão para ele continuar treinando-o foi o desejo final de seu mestre Qui-Gon Jinn. Ele sentia que essa era sua obrigação, mas achava que ele não tinha a habilidade necessária para treiná-lo corretamente. Anakin, por outro lado, sentia que ele era diferente. Por causa dessa diferença, ele se continha bastante, mas gostava de Obi-Wan por ele agir como o pai que ele nunca teve. Lentamente, Mestre e aprendiz começaram a formar um vínculo especial durante a adolescência de Anakin.

Após três anos de treinamento, Anakin e Obi-Wan tiveram sua primeira missão juntos quando investigaram o líder de culto Kad Chun. Chun, chamando-se de Uni, era o co-líder de um bando de idealistas e refugiados que queriam libertar mundos do controle de burocratas. O líder do culto e pai de Kad, Vox Chun, foi morto durante as investigações de Kenobi e Skywalker.

    Sua próxima missão foi no planeta vivo Zonama Sekot, onde eles deveriam encontrar o Cavaleiro Jedi Vergere, que recentemente havia desaparecido em uma missão no planeta. Sem que eles soubessem, Wilhuff Tarkin e Raith Sienar os seguiram para poder explorar a habilidade do planeta de combinar material orgânico com alta tecnologia para gerar naves de excelente qualidade. No planeta, os habitantes venderam “parceiros-semente” para os Jedi, que se juntaram com seus hospedeiros para gerar naves personalizadas. Anakin atraiu mais parceiros-semente que qualquer um, e acabou recebendo uma nave maior e melhor que as outras. Ele nomeou sua nova nave orgãnica Jabitha. Quando Tarkin e Sienar chegaram, o planeta revelou sua consciência aos Jedi, explicando que Vergere havia partido com os misteriosos “Forasteiros Longínquos” para proteger Zonama Sekot. Anakin e Obi-Wan não conseguiram resgatar Vergere, mas decidiram impedir o ataque de Tarkin. Quando Ke Daiv (o segurança de Tarkin que anteriormente havia confrontado Anakin em Coruscant) tentou matar Skywalker, o garoto, em uma fúria incomum, aparentou usar telecinese para explodir Ke Daiv de dentro para fora (mais tarde seria provado que não foi esse o caso). Anakin então foi capturado por Tarkin, mas Obi-Wan conseguiu destruir a nave de Tarkin e resgatar Skywalker. Durante esse evento, Zonama Sekot ativou seu hiperpropulsor planetário e partiu para as Regiões Desconhecidas. Sienar e Tarkin então retornaram para a República. Infelizmente, a nave orgânica de Anakin morreu ao ficar longe de seu mestre. Com a conclusão de sua missão, Anakin e Obi-Wan retornaram para Coruscant.